Mục tiêu việc lại tạo là tạo ra những chú chó thông minh, khỏe mạnh, thích nghi với điều kiện thời tiết địa phương và có giá thành hạ. Để thực hiện nhiệm vụ này, vào năm 1953 một nhóm gồm 10 chú chó được đã được gửi đến từ chương trình đặc biệt huấn luyện chó quân đội K9 tại Bắc Kinh. 10 chú chó này ban đầu sẽ không thể đáp ứng được các nhu cầu cấp thiết đặt ra, nên người ta đã tuyển chọn thêm 50 chú chó giữ nhà từ Côn Minh, 40 chú chó tương tự từ thành phố Quý Dương, tỉnh Quý Châu.

Sau một chương trình huấn luyện nghiêm ngặt, 20 con chó xuất sắc nhất đã được tuyển chọn ra từ 90 con chó nhà ban đầu. Với 10 chú chó từ K9, 20 chú chó nhà nêu trên và thêm 10 con chó chăn cừu Đức thuần chủng được nhập thẳng từ Đức, đã xây dựng được một quỹ gen để tiến hành việc lai tạo ra giống chó Côn Minh. Bộ Quốc phòng Trung Quốc đã chính thức công nhận loại chó này như một giống mới (breed) vào năm 1988.